Церква була збудована 1502 року на кошти місцевих гончарів на місці дерев'яної церкви св.Бориса і Гліба, яку спалили татари.
У XVII столітті у церкві було встановлено новий двоярусний іконостас. Однією з найбільших унікальностей церкви св.Духа є її монументальний стінопис,який датується 1620-1640 роками.
Найстаріша дерев'яна церква Львівщини. Видатна пам'ятка архітектури та монументального мистецтва галицької школи. 21 червня 2013 року на 37-й сесії Комітету Світової спадщини ЮНЕСКО що проходила у Камбоджі Церква Святого Духа була включена у список світової спадщини ЮНЕСКО.